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生物学论文_基于信息传播的致病基因识别研究
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摘要:文章摘要:基因在生命科学领域的研究中占据着重要地位,而致病基因则是关键重心之一。对致病基因的精准识别可以揭示疾病在分子层面的发病机制,为疾病的预防、诊断及治疗等多个
文章摘要:基因在生命科学领域的研究中占据着重要地位,而致病基因则是关键重心之一。对致病基因的精准识别可以揭示疾病在分子层面的发病机制,为疾病的预防、诊断及治疗等多个阶段提供强力支撑。准确识别致病基因的关键在于给出基因之间的相似性度量。文中利用复杂网络对生物系统进行建模,并提出了一种带有耗散机制的多源头重启随机游走模型DRWMR来度量基因之间的功能相似程度。首先基于NCBI等生物数据库构建人类基因相互作用网络,并在KEGG的疾病-基因关联数据集上开展实验对已知致病基因进行识别。与SP,RWR和PRINCE3种现有模型进行比对,DRWMR准确预测了581种疾病中的156种,而其余模型平均正确预测121.3种,DRWMR的平均预测分数相比于其余模型的预测分数均值高出9.46%。最后使用所提模型预测哮喘、血友病和PEHO综合征的潜在致病基因,预测结果均在文献或数据库中找到了理论或实验支持。
文章关键词:生物信息学,复杂网络,信息传播,基因功能预测,
项目基金:国家自然科学基金项目(11671025),
作者单位:2. 鹏程实验室
论文分类号: G206;R394
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文章来源:《传播力研究》 网址: http://www.cblyjzz.cn/qikandaodu/2021/0819/1666.html
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